После событий предыдущих сезонов, когда Сайто помог Тристайну отразить нападение Альбиона и спас возлюбленную Луизу, герои наконец получили возможность наслаждаться мирной жизнью в академии магии и при дворе. Но спокойствие длится недолго: однажды Сайто замечает, что руны, подтверждающие его контракт с Луизой как её подручного, постепенно исчезают с его левой руки.
Второй сезон популярного японского аниме «Подручный Луизы-Нулизы» переносит зрителей обратно в магический мир Тристрании, где бывший японский студент Сайто уже успел привыкнуть к своей новой роли — верного подручного аристократки Луизы, невероятно вспыльчивой и неуклюжей, но при этом очень дорогой ему девушки.
Юити Айзава, обычный старшеклассник, возвращается в родной город, из которого он уехал ещё в детстве, и селится у своей тёти Акико. Он записывается в местную школу, надеясь на спокойную жизнь, но вскоре понимается, что прошлое не отпускает его так просто: вокруг него снова появляются знакомые с детства места, а в памяти всплывают обрывки воспоминаний, которые он не может сложить воедино.