Действие фильма разворачивается в Токио 1989 года, в период глубоких социально-экономических перемен, когда после лопнувшего пузыря недвижимости старая уверенность в стабильности уступает место неопределённости. Главная героиня, замкнутая переводчица Люси, несколько лет назад сбежала от тяжёлых семейных проблем в США и теперь старается не привлекать к себе внимания, не заводить близких связей...
После событий «Люди Икс: Последняя битва» Логан, измученный бессмертием и потерей всех близких, скрывается в отдаленных горных районах Канады, отказываясь от контактов с людьми и не желая больше использовать свои суперспособности. Его тихую жизнь нарушает старый знакомый, который предлагает ему отправиться в Японию и встретиться с человеком, чью жизнь Логан спас много лет назад во время войны.