История, основанная на библейском сюжете, переносит зрителя в эпоху древней Иудеи, где добрый и смелый юный пастух Давид заботится об отцовском стаде, защищает овец от хищников и проводит вечера, играя на арфе и сочиняя песни. Его размеренная жизнь меняется после встречи с пророком, который предрекает юноше великое будущее и путь, который приведет его к вершине власти.
Гильермо дель Торо переносит классическую историю о Пиноккио в контекст 1930-х годов, добавляя в сюжет отсылки к политической ситуации того времени в Италии. Режиссер не просто повторяет знакомый с детства сюжет о деревянной кукле, которая мечтает стать живым мальчиком, а предлагает зрителю глубокую размышление о том, что такое доброта, смелость и любовь к близким.