После событий первого фильма Шао Кан не оставил попыток захватить Земное царство и подчинить себе вселенные. Его армия темных воинов уже готова к вторжению, а защитники мира вынуждены не только отбивать атаки извне, но и разбираться с внутренними раздорами, которые могут стать фатальными для всего живого.
