Продолжение истории вселенной Зверополиса возвращает зрителей в тот самый многоликий мегаполис, где хищники и травоядные живут в мире и сотрудничают, а в каждом районе скрывается своя уникальная история. В этот раз спокойствие города нарушает неожиданное прибытие таинственной рептилии, чьи действия ставят под угрозу сложившийся уклад и заставляют местных жителей нервничать.
Получив стипендию в престижный новозеландский университет, молодая китаянка Вэй переезжает к тёте, у которой живёт дочь, учащаяся на том же медицинском факультете. Девушка годами комплексует из-за заметного родимого пятна на лице, поэтому мечтает продолжить работу отца, погибшего во время разработки революционного средства, способного избавить людей от любых несовершенств кожи.
Энни провела три десятилетия в роли идеальной жены провинциального священника Джейкоба: ее дни состоят из приходских дел, уборки дома и выполнения всех общественных обязательств, а в голове уже давно царит скука от бесконечной размеренности, от того, что все вокруг видят в ней только тихую, покладистую женщину без собственных желаний.
Роуз работает ассистенткой известного модельера, но её собственная карьера в индустрии моды рушится в одно мгновение после серьёзной аварии, которая оставляет на её лице глубокие шрамы. Врачи отказываются помочь ей вернуть прежнюю внешность, и девушка решается на рискованное экспериментальное лечение в закрытой частной клинике, специализирующейся на стволовых клетках.