Спустя 18 лет после завершения оригинальной трилогии Лилли и Лана Вачовски вернулись во вселенную «Матрицы», чтобы показать, что стало с главными героями после падения системы контроля машин. Сюжет разворачивается вокруг Томаса Андерсона, известного геймдизайнера, который создал трилогию игр по мотивам событий первой части франшизы и получил известность благодаря этому проекту.
Маргарет, американская преподавательница английского, переезжает в Токио, пытаясь оставить позади тяжёлые события из своей прошлой жизни, которые преследуют её в США. Днём она ведёт уроки для студентов, а вечером отправляется исследовать ночную жизнь мегаполиса, который для неё становится одновременно убежищем и ловушкой, полной неожиданных встреч и скрытых опасностей.
Спустя несколько лет после событий первой части Белоснежка взошла на трон своего королевства, но спокойствие оказалось недолгим: вернулась Рэйвенна, сестра покойной королевы, обладающая ледяной магией, которая стремится захватить все соседние земли и установить свою власть над миром. Чтобы остановить её, королеве нужна помощь того, кто уже однажды побеждал злую колдунью — бесстрашного Охотника...