После событий первого фильма Джейк Салли полностью растворился в образе аватара, стал предводителем клана на'ви и построил счастливую жизнь с Нейтири, у них родилось двое детей. Но на Пандору возвращаются до зубов вооруженные земляне, которые уже не скрывают своих корыстных целей — они хотят выкачать все ресурсы планеты, не обращая внимания на ее обитателей.
Это последняя роль Хью Джекмана в образе Логана, которую он играл на протяжении 17 лет — прощальный акт для одного из самых узнаваемых персонажей киновселенной Marvel. Действие разворачивается в недалеком будущем, где большинство мутантов погибли, а оставшиеся живут в постоянном страхе перед правительственными службами, охотящимися за людьми с необычными способностями.
События разворачиваются в сентябре 2012 года в ливийском городе Бенгази, где на американское консульство совершается скоординированная атака вооруженной группировки боевиков. В тот момент на территории объекта находятся не только дипломаты и сотрудники государственных структур, но и шестеро бывших военных спецназа, нанятых для обеспечения безопасности комплекса.