Действие картины разворачивается в викторианской Англии 1884 года, в канун 16-летия Энолы Холмс её мать бесследно исчезает. Девушка росла под руководством прогрессивно мыслящей родительницы, которая давала ей необычное для того времени образование: она умеет драться, разгадывать шифры и отказывается соответствовать строгим нормам поведения, предписанным для молодых особей её круга.
«Призрачная нить» — последняя на тот момент работа Пола Томаса Андерсона, который самостоятельно написал сценарий к картине и пригласил на операторскую работу Микаху Эллиота, с которым ранее не сотрудничал. В главной роли Рейнольдса Вудкока — Дэниел Дэй-Льюис, который после завершения съемок объявил о временном уходе из кино.
Лу Кларк живет размеренной, но не слишком радостной жизнью: она работает в местном кафе, не строит далеко идущих планов, а ее отношения с бойфрендом Патриком давно потеряли былую близость. Когда Лу неожиданно теряет работу, она вынуждена искать новый источник дохода и берет вакансию сиделки у молодого человека по имени Уилл Трейнор, который после страшной мотоаварии остался прикован к...