События фильма происходят в конце 1950-х годов в небольшом городке Каюга, штат Нью-Мексико, где почти все жители собрались на вечерний баскетбольный матч местной команды. В этот вечер на ночные дежурства остаются только юная Фэй, которая работает телефонисткой и увлекается статьями о достижениях науки и техники, и её приятель Эверетт, ведущий ночную радиопередачу.
«Темные тайны» — экранизация одноименного романа Гиллиан Флинн, автора бестселлера «Исчезнувшая», вышедшая в 2015 году. Действие фильма строится вокруг Либби Дей, единственной выжившей после массового убийства, произошедшего в её доме в 1985 году: в ту роковую ночь погибли её мать и две шестилетние сестры, а в преступлении сознался её старший брат Бен, который до сих пор отбывает пожизненное...